Покровская церковь по своей архитектуре относится к тетраконховому типу храмов. Центральная квадратная часть увенчивается высокой башней с куполом, с четырех сторон пристроены меньшие полукруглые сооружения – конхи. Этот стиль в архитектуре был особенно популярен в странах, поддерживающих византийскую культуру. Согласно исследованиям украинского ученого В. Вечерского, тетраконховые храмы строились в Украине с 1755 по 1800 год. И именно Черниговская область стала центром их сооружения. Как раз в этот период и строилась церковь в Нежине. Точная дата строительства не сохранилась. По информации взятой из старинных документов, в начале XVII века на месте Покровской церкви стоял деревянный православный храм Рождества Богородицы. В районе 1636 года храм был перестроен. В 1757–1765 годах Черниговские купцы собрали средства на строительство новой каменной церкви, которая сохранилась до наших дней. В советские времена храм потерпел разруху, многие оригинальные элементы были разбиты и утрачены навсегда. В 1993 году началось возрождение Божьей обители, всей религиозной общиной собирались деньги и проводились ремонтные работы, которые закончились только в 2001 году.