Первыми разрушителями в 1239 году храма были ордынцы. Своего часа церковь ждала до второй половины XVII столетия, когда черниговский полковник Василий Дудин-Борковский на свои средства отстроил ее. Храм обрел семь куполов и множество иных черт стиля украинского барокко, присущих культовым сооружениям, и вошел в комплекс строений монастыря. В 1750 году случился большой пожар, после которого церковь пришлось отстраивать. В 1820 году к зданию храма была пристроена колокольня-ротонда, гармонично дополнившая композицию в стиле барокко. Еще один пожар пережила церковь в 1862 году. Она была вновь восстановлена, но очень изменилась внешне. В начале ХХ века при храме были организованы два учебных заведения и библиотека. В годы Второй мировой войны попавшая в церковь советская авиабомба разрушила ее очень значительно. В 1943-1945 годах были проведены работы по консервированию руин, а затем 17 лет храм восстанавливали в его первоначальном виде времен Руси. В 1972-1989 годах в здании церкви размещалась историческая экспозиция, рассказывающая об истории храма. С 1991 года Пятницкая церковь вновь действует. Сейчас храм принадлежит Украинской православной церкви Киевского патриархата. Здесь каждый день проходят богослужения, совершаются церковные таинства.