Музей был открыт в мае 1985 года. Его первый зал посвящен событиям Национальной Освободительной войны украинского народа 1648–1654 годов и победе Богдана Хмельницкого на Желтой реке 16 мая 1648. В экспозицию включены мемориальные экспонаты: казацкая трубка конца XVII века, наконечник казацкого копья, доспехи польского рыцаря XVII века. Второй зал отражает развитие поселка Желтая Река. Здесь можно увидеть макеты львовского карьера, шахты "Капитальная", коллекцию старинных предметов быта. Третий зал ("Боевой Славы") отражает годы Великой Отечественной войны. Здесь собраны фотоматериалы, оружие времен войны, немецкий штык, каска, фляга и др. Четвертый и пятый залы освещают историю развития города и предприятий, спортивную и образовательную жизни. Здесь можно увидеть макет города Желтые Воды. В пяти залах второго этажа выставлена коллекция часов, минералов, графики, живописи, художественной вышивки и скульптуры, а также экспонируются картины желтоводских художников. С 1999 года музей носит имя почетного гражданина города Ефима Ильича Пригожина – инициатора создания городского музея.