Музейные экспозиции расположены в трех тематических комнатах. Многочисленные исторические материалы позволяют посетителям проследить историю края от времен глубокой древности до наших дней. Собранные материалы размещены в порядке хронологии. Значительное внимание уделено истории основания села Нерубайки. Гордостью Нерубайского историко-краеведческого музея является украинская традиционная материальная культура, которая детально отображена в многочисленных материалах, фотографиях и документах. В музее представлена большая коллекция оружия различных эпох. Территориальная близость села Нерубайки к печально известному урочищу "Зеленая брама" позволила собрать большое количество экспонатов времен Второй мировой войны: оружие, обмундирование, личные вещи солдат.