Реставрационные и ремонтные работы проводились в костеле Рождества Иоанна Крестителя в 1901-1904, 1913-1919 и в 1933 годах. После Второй мировой войны храм оставался действующим. В конце 70-х годов прошлого века из костела забрали главный алтарь, который был сделан в неоготическом стиле и украшен фигурами Божьей Матери и Иоанна Крестителя, созданными мастером Долабелле. Одно время его заменял алтарь из Старого Самбора. В последнее время его заменил алтарь из костела в Мильчицах, который преобразован в церковь. Костел Рождества Иоанна Крестителя в Мостиске внесен в список памятников архитектуры, охраняемых государством.