Храмовое сооружение было возведено в 1880 году из дерева. В конце ХХ столетия здание церкви было капитально перестроено, поэтому на данный момент Заболотская церковь Перенесения мощей Святого Стефана находится в удовлетворительном состоянии. Возведена церковь в стиле народной архитектуры, для которой характерны деревянные постройки, вид и материал которых обусловлен ландшафтными особенностями, а также типичные архитектурные приемы и декорирование фасада. Церковь Перенесения мощей Святого Стефана имеет трехдольную форму строения.