Фонд музея насчитывает более 34.000 экспонатов, относящихся к различным историческим периодам. Они размещены в трёх тематических залах. Первый полностью посвящён трипольской культуре. Второй зал охватывает период от палеолита до бронзового века. В третьем можно узнать историю славянских племён, Киевской Руси и эпохи казачества. Благодаря археологическим раскопкам фонд музея постоянно пополняется новыми экспонатами.Здесь можно приобрести сувениры: точные копии трипольской посуды, фигурок священных животных, ритуальных керамических сосудов-"биноклей".