Заведение состоит из трех больших залов, занимающих весь третий этаж здания Харьковского театра кукол. Первый посвящен истории самого театра Афанасьева. Здесь же демонстрируются игравшие в нем куклы. Во втором зале создана экспозиция, посвященная основавшим и развивавшим харьковскую кукольную драматургию людям. Также здесь можно ознакомиться с уникальной коллекцией театральных кукол из разных стран мира (например, плоскостные персонажи из спектакля "Король Убю" Мишеля Мешке или мальчик Цэндэрикэ из одноименного румынского театра). Третий зал посвящен всемирной истории искусства театра кукол от античных времен до наших дней. В нем также представлена крупнейшая в мире тематическая коллекция значков, связанных с кукольной драматургией. Ознакомиться с экспозициями музея можно при посещении спектаклей.