До средины 1930-ых годов храм носил название Николо-Иорданского. Согласно историческим сведениям, земля, на которой он стоит, была местом молитв первых христиан еще до крещения Руси. Многие говорят о некой духовной силе этих мест и наличие чудодейственного источника только доказывает это. Об истории зарождения храма в IX-XII веках свидетельствуют только некоторые летописи и археологические исследования. В XIX веке здесь были найдены его фундаменты. Древнерусский храм был уничтожен во время нападения татаро-монгольского ига. Первое возрождение храма началось в 1616-ом году, когда здесь появился Иорданский женский монастырь. На его территории был построен деревянный храм, который сгорел в 1821 году. Через 63 года было возведено каменное здание. Его ликвидировали и разобрали во времена советской власти. Новое дыхание храм получил уже в 2004 году, именно тогда была проведена первая за столько лет литургия. Сейчас здесь активно ведется реконструкция, проводятся молебны, действует воскресная школа. Также работает сестринство милосердия, которое помогает пациентам больницы и кормит бездомных.