За время своего существования церковь принадлежала к четырем конфессиям: к ордену Паулинов, Украинской греко-католической, Российской православной и Украинской автокефальной церквей. За время своего существования строение не раз поддавалось грабежам и разрушениям. Изначальное однонефное здание не сохранилось, ввиду того, что в XVIII веке было перестроено. В 1989 году настоятель храма Владимир Ярема принял решение о переходе церкви под патриархат Украинской автокефальной православной церкви, после чего стал патриархом УАПЦ и в 2000 году был похоронен во дворе костела.