Храм Николая приобрел сегодняшние очертания в середине XVII века. Точная дата конца строительных работ не известна, но местные краеведы утверждают, что храм возводился в период с 1650 по 1670 годы. Раньше на этом же месте стояла одноименная церковь, построенная из дерева. Исторические летописи гласят, что каменное сооружение возводили казаки из Нежинского полка, средства на строительство выделили братья Василий и Иван Золотаренко. До сегодняшних дней сохранился оригинальный текст документа, в котором нежинская мещанка в своем завещании указала передать третью часть ее сбережений для строительства храма. Собор Святого Николая отражает черты раннего украинского барокко.