В некоторых старинных летописных документах можно найти информацию о том, что в далеком 1339 году на службу к венгерскому королю прибыл князь из Подолии по имени Федор Корятович. Именно при его поддержке на Чернечей горе была возведена деревянная церковь и маленький корпус для монахов. Игуменом назначили монаха Луку. С 1491 года монастырь становится центром православия Закарпатья. В 1537 году на территории края было неспокойно, так как воевали Габсбурги и трансильванские князи. Во время военных действий святую обитель разрушили, большая часть архивных документов была утрачена. В 1538 году епископ Василий I при поддержке императора Фердинанда І решил возродить монастырь. В 1646 году на Закарпатье была провозглашена уния с римской церковью. В этот период православным епископом выбрали Иоаникия. Именно во время его епископата в 1661 году на территории монастыря воздвигли первую каменную церковь. Монастырь из камня строился в 1766-1772 годах, а Свято-Николаевская церковь – с 1798 по 1804 годы. Долгие годы (с 1664 по 1946) монастырь принадлежал католическому монашескому ордену отцов василиян. И только в 1947 году советская власть вернула его истинным владельцам. Сюда перебрались монахини из святой обители Рождества Пресвятой Богородицы села Липча.