Крипта – крытое подземное помещение, которое традиционно расположено под хоральной и алтарной частями храма. Его обычно использовали для погребения мучеников и святых, а также здесь выставлялись мощи тех людей, которые после их смерти были причислены церковью к лику святых. Такое помещение было и в подземелье тернопольского собора Непорочного Зачатия Девы Марии, только оно многие годы было запертым и засыпанным землей. Было принято решение провести работы по расчистке крипты, поэтому теперь каждый желающий, спустившись по каменным лестницам на глубину пять метров, сможет попасть в сакральный подземный ход храма. Кроме того, часть музейного помещения можно осмотреть через сверхпрочное стекло в полу.