Комплекс Николаевской церкви-мавзолея является неотъемлемой частью Национального музея-усадьбы выдающейся личности Н. Пирогова. В 1881 году над склепом построили небольшую часовню. А в 1885 году возвели Николаевский храм, который спроектировал архитектор академик В. Сычугов. Во время Второй мировой войны саркофаг с телом врача зарыли в землю, после чего проводились реставрация и повторное бальзамирование. Храм также пережил реконструкцию. В праздничные и памятные даты в Николаевской церкви проводят богослужения, звучат духовные произведения известных классиков и колокола.