Истоком музея истории вуза следует считать учебный исторический музей, который создал доцент Я. Рубин еще в середине прошлого века. Значительная часть этого собрания вошла в фонд музея истории университета. Значительный вклад в становление и развитие вузовского музея внесла его многолетняя руководительница Е. Ефремова. Экспозиция музея истории ДГУ охватывает период от его создания в 1918 году до наших дней, включая научные разработки студентов и преподавателей, международные связи вуза. Более восьми тысяч единиц хранения насчитывают фонды музея, в экспозиции их выставлено около 250. Музей находится в Потемкинском дворце – старейшем архитектурном памятнике города. Сейчас это Дворец студентов. Здание было построено в конце XVIII столетия архитектором И. Старовым – одним из основателей российского классицизма. Вторая мировая война не пощадила сооружение, оно было разрушено. В 1952 году его начали восстанавливать. Авторы проекта реставрации – архитекторы А. Баранский и С. Глушков, инженер А. Мучник. Хотя архитектура дворца была значительно изменена, он не утратил своего величия и красоты.