Общая территория заказника составляет 46,0 га. Как известно, на территории Шацкого заповедника большую часть занимают водно-болотные ресурсы, среди которых изучаются все населяющие их организмы, а также растительность. Озера впадают в реку Западный Буг, а это значит, что они относятся к бассейну уже Балтийского, а не Черного моря. Что касается остальной местности, то около трех десятков образцов флоры и примерно столько же представителей фауны занесены в Красную книгу и подлежат особой охране и сохранению видов. Помимо ихтиологической составляющей, для путешественников особый интерес представляют чистые сосновые леса с особенным типом почвы и климатом. В общих чертах, сотрудники музея осуществляют в заказнике хозяйственную, научную и охранную деятельность, тщательно следят за всеми видами и позволяют изучать их с академической точки зрения, а также предотвращают исчезновение особенно редких образцов.