В 1849 году архитектором Малининым церковь перестроена и расширена, создан во имя иконы Божьей Матери Казанской боковой алтарь. В 1839 году обветшавшую звонницу разобрали. В 1863 году архитектор Иванов создал проект каменной колокольни, которую построили в 1865–1872 годах. Трехъярусное сооружение с более широким нижним ярусом, разделенным на три части: в центральной – проход к церкви, а боковые – подсобные помещения, окна которых оформлены оригинальными наличниками и сандриками. Во втором ярусе, имевшем в плане форму прямоугольника, арочные проемы украшали спаренные пилястры. Третий ярус – восьмигранник, над которым – граненый купол с маковкой. В это же время церковный участок оградили кирпичной стеной. В конце ХІХ столетия появилась невысокая граненая ротонда, пристроенная ко входу на западном фасаде. В начале ХХ века на территории выстроили домик священника – одноэтажный, деревянный, обложенный кирпичом. В 1930 годах церковь закрыли, разрушили купол и частично ограждение, колокольню сравняли с землей, оставив лишь фундамент. Богослужение в храме возобновили только в период немецкой оккупации – в 1942 году. Ныне церковь действующая. Спасо-Преображенский церковный комплекс имеет историческую ценность не только как памятник архитектуры, но и как место, связанное с именем Филофея Лещинского – церковного деятеля и просветителя.