Станцию открыли в 1876 году. С 2015 года на железнодорожном пункте проводили работы по увеличению пропускной способности. Планировалось в дальнейшем, что станция Геническ станет конечной для железнодорожного транспорта дальнего назначения. Однако с 2017 года (в связи с уменьшением пассажирского потока) движение поездов временно прекращено, посему составы следуют до станции Новоалексеевка. В здании вокзала работает билетная касса, предоставляются услуги оформления багажа, а также совершаются прием и выдача вагонных грузов. Через станцию Геническ проходят поезда в направлении Киева, Днепра, Кривого Рога, Ивано-Франковска.