С целью сохранения истории Николаевского 100-летнего зоопарка в 1988 году создали его музей. Экспонаты собирали со всевозможных уголков и коллекций. На стенде основателя зоопарка Н. П. Леонтовича размещаются фотографии и другие памятные артефакты, а по центру музейного помещения установлен его портрет. В центре зала установлен макет нового парка животных 1989 года. Но больше всего внимание посетителей привлекают коллекции "мокрых" экспонатов. В емкостях из стекла сохраняются черноморская рыба "морской петух", а ее фотография конца 20-х годов XX века также выставлена на обзор, зародыш кита финвала, разновиды новорожденных животных и некоторые отдельные их органы, гельминты. Большую часть музейной экспозиции составляют собрания из чучел и черепных коробок животных, начиная от миниатюрной ласки и дымчатого леопарда, и заканчивая слоном и бегемотом.