Монахи здесь вели особо аскетический образ жизни. Со временем в монастыре открыли богословскую школу и типографию. Интересен тот факт, что все происходящие в обители важные события иноки записывали на стенах часовни и храма. Но в XVI-XVII веках на монастырь обрушились несчастья. Сперва обитель разорили во время двух набегов. А затем из-за трех эпидемий болезни, которая в источниках называется моровой язвой, умерли почти все монахи. Восстановление обители началось в 1901 году, когда Почаевская лавра заложила на том же месте нынешний скит Святого Духа. Но во времена атеистических гонений его разорили и закрыли, а монахи вынуждены были переселиться в Почаевскую лавру. Еще одно восстановление скита началось в 1990 году. Тогда возобновились богослужения, духовная жизнь и хозяйственная деятельность насельников. Была реконструирована вратарная церковь Онуфрия Великого, храм Всех Святых, возведен корпус для келий, построена каменная ограда вокруг обители. Сейчас в ските хранится чудотворная икона, мощи преподобного Мефодия и другие святыни.