За все годы существования церкви внутреннее убранство осталось практически неизменным. Первое, что привлекает внимание, – это настенная роспись конца XVIII века: "Страшный суд" и "Георгий Победоносец". Церковь Рождества Богородицы состоит из 2 этажей. Наверху расположилась галерея с амбразурами и две часовни, построенные в честь святого Георгия и великомученицы Варвары, ку которым ведет винтообразная лестница. Бытует легенда, что в 1823 году в Черновцах при встрече императоров Австрии и России церковь навестил царь Александр I.