Даний музей був заснований в 1784 році і є найстарішим університетським музеєм не тільки України, але і Європи. У фондах музею зібрані експонати з усіх континентів світу. У чотирьох залах музею загальною площею близько 500 квадратних метрів виставлено на загальний огляд понад 10 тисяч експонатів. Колекції унікальні, вони дають важливу інформацію науковим дослідникам про проблеми зміни навколишнього середовища і функціонування біосфери. Серед експонатів – безхребетні тварини (молюски, корали, губки), птиці (серед яких унікальні колібрі і нектарниця), ссавці (всілякі мумії тварин). У 2003 році коротка інформація про музей увійшла в дев’яте видання Каталогу музеїв світу, а орнітологічна колекція увійшла в огляд основних Європейських колекцій птахів. За важливий внесок в розвиток української музейної справи 27 грудня 2012 року музею було присвоєно звання народного.