Зараз в експозиції музею є кілька розділів, що оповідають про природу та історію рідного краю. Найважливіший розділ музею, що розкриває історію міста та його околиць, має зібрання археологічних знахідок, документів і фотографій, картини і предмети декоративно-прикладного мистецтва, побутові предмети, матеріали про охтирські козацький і гусарський полки. Під час війни 1812 року саме в Охтирському гусарському полку служив уславлений герой Денис Давидов. Цікавляться відвідувачі й експонатами щодо їхнього земляка – українського поета, письменника, політичного діяча і публіциста Івана Багряного (справжнє прізвище Лозов’яга). Окремий зал музею надано для проведення тематичних виставок тутешніх художників та майстрів народних промислів. Співробітники музею проводять екскурсії не тільки приміщенням, а й містом і його околицями.