Природний комплекс заплави Берди є унікальним, оскільки добре зберігся на відміну від інших територій Північного Приазов’я, які зазнали антропогенних змін. Тут збереглися степові ділянки з типовою рослинністю, в якій переважають ковила, у тому числі й червонокнижні волосиста і Лессінга. Виростають тут тюльпани Шренка. Тутешні території є місцем гніздування багатьох видів птахів, серед яких – червоношиї казарки, білоока чернь, кулик-сорока, що входять до Червоної книги України. Акваторія заповідника – місце нерестовища різних риб. У заплаві Берди можна зустріти рідкісних метеликів – махаонів і поліксен, що також охороняються Червоною книгою.