На месте современной церкви с XIII по XVI век находился монастырь, к которому примыкал целый оборонный комплекс, однако он был разрушен татарами вследствие их набега на Збараж. В 1600 году князь Иван Збаражский возвел новый трехдольный каменный храм, что было весьма типичным для подольского церковного зодчества. Колокольня представляла собой двухъярусную оборонную башню, в которой были прорезаны бойницы. Вход нетрадиционно расположен с южной стороны, а не с западной. Толщина стен составляет порядка двух метров. Согласно легенде, святыню посещал сам Богдан Хмельницкий и принес в дар несколько икон. В конце XVII века здесь отстраивается монастырь и начинают селиться монахи, однако процветание продолжалось до того момента, пока обитель не отдали униатам. Даже Иван Мазепа как-то отстоял службу здесь. В связи с отходом земель Австро-Венгерской империи комплекс был перепродан и реконструирован. Уже в советские времена храм был изуродован вандалами, которые нанесли урон внутреннему убранству помещения. До наших дней сохранилась уже отреставрированная церковь.