Как и воды всех Шацких озер, воды Перемута обладают определенными лечебными свойствами. Отличительной особенностью, благодаря которой Перемут имеет такое название, является большое содержание в воде сапропелевого ила. Если воду немного взболтать, то она станет очень мутной. Здесь наблюдается большое разнообразие видов рыбы, как и в соседнем озере Луки, с которым Перемут связан каналом (лещ, щука, плотва, линь, угорь, канадские сомики и другие). Общая площадь озера составляет 1,46 км², а максимальная глубина – около 6,7 м. Перемут имеет очень низкие и заболоченные берега, заросшие камышом, на которых гнездится множество птиц.