У невеликому одноповерховому будинку, де жив Заболотний, відтворений інтер’єр початку XX століття і представлено особисті речі науковця. У будівлі, яка раніше служила літньою кухнею, зберігаються експонати, пов’язані з науковою та медичною роботою. Загалом колекція музею налічує понад дві тисячі предметів. Серед них – студентські конспекти, перші наукові праці, сімейні фотографії, документи. Збереглися особиста бібліотека академіка, яка налічує понад 700 книг, а також колекція мінералів. Частина виставки присвячена експедиції Заболотного в Маньчжурію і першій в історії вакцинації проти чуми, яку здійснив учений. Музей Д. Заболотного щорічно відвідує понад три тисячі осіб.