Експозиція відділу "Природа краю" в доступній формі представляє геологічну історію і будову регіону, його флору та фауну. Тут можна побачити корисні копалини, опудала тварин і кістки мамонтів. У відділі "Історія краю" представлений макет Шостки ХІХ століття. Увагу відвідувачів привертають старовинні речі домашнього побуту, народний одяг, знаряддя праці. Значну площу відведено під експонати часів Великої Вітчизняної війни. Фонди відділу кінофототехніки висвітлюють розвиток вітчизняної хіміко-фотографічної науки і промисловості. В сквері біля музею під відкритим небом розташована експозиція бронетехніки та артилерії. У виставковому залі влаштовуються різноманітні заходи, тематичні й художні виставки, на яких демонструють свої праці художники, майстри декоративно-прикладного мистецтва, різноманітні творчі об’єднання.