Над созданием костела работал известный архитектор Павел Гижицкий. Строительство завершилось в 1755 году, через несколько лет его освятили. При костеле был открыт монастырь. Однако уже в 1773 году указом папы Климента XIV все иезуитские учреждения в России и Польше были закрыты и представители ордена покинули город. Вскоре в костеле обосновались василианы. В конце XVIII века орден перевели в православие. Внутренний интерьер был изменен и переделан под резиденцию владимирских епископов. Когда в 1921 году земли Волыни перешли к Польше, костел вновь стал римо-католическим, а его первоначальный облик был частично восстановлен. В 1945 году советская власть ликвидировала приход, а храм закрыла. В начале 1980-х, здесь началась основательная реставрация.