Город Могилев-Подольский был основан в 1595 году. Первые упоминания о проживании евреев на его территории датируются 1637 годом. Численность еврейской общины на протяжении веков на территории города постоянно росла. К началу XX века здесь функционировало шесть еврейских мужских и женских училищ, 17 молитвенных домов, еврейская больница и синагога. Здание синагоги, сохранившееся до наших дней, было построено в конце XIX века. Сейчас его помещения занимает протестантская церковь.