Второй раз церковь перестраивали в 1788 году. А некоторые источники указывают именно эту дату как год постройки церкви. Одновременно с реконструкцией на территории комплекса появляется колокольня. Она выполнена в том же стиле, что и церковь. В высоту здание поднимается на два яруса. Первоначальный интерьер храма до нашего времени не сохранился, не уцелел и аутентичный иконостас. Сейчас от него остались лишь две иконы – "Спас" и "Богородица". Эти иконы нарисованы темперными красками на дереве. Современный иконостас появился в Михайловской церкви в XIX веке, во время очередной реконструкции; тогда же были расписаны стены храма. Фрагментарно эта роспись сохранилась до нашего времени и была дополнена современными местными мастерами во время последнего "обновления".