Вокзал у Глухові побудували ще два століття тому – в 1895 році. Сьогодні йому 122 роки. Спочатку місцева влада вирішила будувати вузькоколійну дорогу для маршруту Ворожба – Зернове. Проходила через Глухів. Для цього в місті побудували будівлю вокзалу і ще житлові будинки для персоналу. З 1917 року шляхи замінили на широкі. За часів Другої світової інфраструктура вокзалу сильно постраждала. У 1950 роках станція перейшла під юрисдикцію Південно-західної залізниці. У 1961 році станцію було істотно відремонтовано. У 1963 році саме тут розвантажували ракети для відправки на Кубу, що спровокувало Карибську кризу. Сьогодні через станцію їздять потяги як внутрішньообласні, так більш далекого прямування. На вокзалі є квиткова каса і довідкове бюро.