История монастыря начинается упоминанием 11 июля 1108 года в летописании о заложении князем Святополком-Михаилом рядом с Дмитриевским монастырем и церковью св. Петра каменного храма в честь св. Архистратига Михаила. В то время это была единственная церковь с золотым верхом, именно поэтому она получила название Златоверхой. В первоначальном виде собор был деревянным и имел небольшие размеры. В 1093 году киевский князь Святополк ІІ Изяславович приказал построить вместо деревянной церкви каменный храм, украшенный мрамором, мозаикой и драгоценными иконами. На протяжении столетий весь комплекс зданий на территории Михайловского монастыря значительно расширился. Серьезные изменения произошли в Х VІІ-Х VІІІ столетии, когда при значительном финансовом влиянии украинских гетманов и чиновников удалось улучшить состояние устаревших строений. Например, гетман Богдан Хмельницкий обновил позолоту на центральном куполе храма, а в 1718 году гетман Скоропадский организовал в главной церкви новый иконостас.После революционных разрушений храм был заново открыт 30 мая 1999 года. На территории комплекса находятся Киевские духовные школы УПЦ КП. Колокольня оборудована современными электрическими часами-курантами и карильоном для исполнения сложных мелодий. На фронтоне установили копию древней скульптуры Архистратига Михаила.