Малая синагога была построена в начале 20-х годов прошлого столетия. Изначально в Берегово было шесть синагог, но во времена советского режима они были разрушены или закрыты. Действующей же осталась только одна святыня – малая синагога. При ней была также построена еврейская ритуальная баня. Несмотря на то, что верующих евреев в Берегово насчитывается не более 40 человек, малая синагога и поныне остается действующей. Некоторое время здание находилось в полуразрушенном состоянии. В 2012–2014 годах при поддержке Министерства иностранных дел Венгрии была проведена реконструкция синагоги. Тогда в здании заменили окна, крышу, отремонтировали мебель, но внешнее убранство не изменилось. На первом этаже малой синагоги расположены комната для молитвы и большой зал, где проходят культурные и религиозные мероприятия. Здесь также открыт музей, в экспозиции которого представлены памятные вещи, предметы и фотографии, переданные жителями Закарпатья и принадлежавшие когда-то евреям.