Монастырь является одним из старейших сооружений Волыни, выполненных в византийском стиле. Основное здание этой святыни – это двухъярусная каменная церковь, с южной стороны которой расположен корпус для проживания братьев. Здесь сохраняются иконы Всемилостивой Божьей Матери, Святого Иоанна Милостивого и мученика Мамонта вместе с частью их мощей. В 1637 году Ирина наделила монастырь в довечное пользование прудом, мельницей, полями и сенокосами. Ее сын и внук также были щедры к общине и подарили им два угодья. Вскоре недалеко от монастыря возникло селение с названием Малые Загайцы. За пользование их землею сельчане помогали монахам с выполнением сельской работы. В начале XVIII столетия предки основательницы монастыря перешли в католицизм, впоследствии чего в 1709 монастырь вынуждали перейти в унию путем нанесению вреда сооружению. В 1721 г. его полностью передали в унию. При новом настоятеле монастырь был постепенно восстановлен. С 1794 года монастырь вновь стал православным с зачислением во внештатные. В период с 1813 по 1853 годы в его стенах находилось духовное училище. В середине XIX века монастырь перевели в разряд трехклассных, а с 1865 года к нему приписали Кременецкий Богоявленський монастырь. В 1899 году 4 июня во время грозы сгорел купол и разрушилась часть стены большой церкви. Вскоре неизвестный пожар уничтожил еще значительную часть монастыря и продовольственные сбережения монахов. В архиве хранились необычайно ценные книги и рукописи. Одним из важнейших раритетов была Библия первого славянского издания, напечатанная в Остроге 1581 года (хранилась в монастыре до 1914 года). С приходом большевиков монастырь был практически полностью уничтожен. В 1964 году его сняли с регистрации как религиозное сооружение и передали для культурных целей. В 80-х годах большую часть келий было разрушено. С октября 2001 года после благословения архиепископа Тернопольского и Кременецкого начались ремонтно-восстановительные работы в монастыре. Возникла потребность в значительных средствах для того, чтобы наладить связь, газо- и водоснабжение. Также возникла проблема с возвращением земель монастырю, поскольку документы по праве на владение ними были уничтожены.