Ценность экспозиции музея состоит в том, что большая часть того, чем богаты залы музея, – это подлинные вещи древних народов, населявших когда-то Поднепровье. Это типичные орудия труда, привычные кочевникам и земледельцам предметы быта, грозное оружие и уникальные украшения того времени. Функциональные изделия из примитивных материалов, мастерски созданные ремесленниками и простыми кочевниками, собраны во время проведения археологических изысканий на местах расположения древних городищ. Большую часть предметов, представленных в музее, удалось собрать во время раскопок поселения, когда-то располагавшегося на месте современного Холодного Яра. Экспозиция распределена на восемнадцать тематических подгрупп, охватывающих разные времена и культурные сословия. Сам Национальный историко-культурный комплекс, в состав которого входит музей, достаточно большой.