История поселения Черневцы уходит своими корнями в далекое ХV столетие и тесно связана с Польшей, в состав которой оно долгое время входило. Одним из известных шляхетских родов, связанных с этим населенным пунктом, является фамилия Маньковских, которые соорудили здесь свой семейный склеп-мавзолей, дав ему имя равноапостольной Марии Магдалены. Но это только одна из версий. Согласно другой, церковь построил на кладбище местный священник Тимофей Пилин, скорбя об умершей малолетней дочери по имени Мария. Какая из двух историй является истиной, сегодня сказать невозможно и даже среди местных жителей по поводу истории возникновения часовни нет единого мнения. Утверждают, однако, что изначально церковь находилась под католической епархией, однако позже стала православной, причем именно здесь, в мавзолее, до строительства нового храма в поселке, проходили все церковные службы.