Станцію було збудовано у 1898 році, під час зведення нової гілки Чаплине – Бердянськ. Одноколійна залізниця була прокладена всього за три роки. І вже у 1909 році через неї пройшло близько 26 тисяч вагонів із зерном, які прямували у Бердянський порт. З приводу того, що ж стало причиною назвати станцію саме Мечетною, існує кілька припущень. Однак сама переконлива версія, що неподалік від станції колись були знайдені руїни мечеті.