Первоначально в 1969 году были открыты археологический и палеонтологический отделы музея. Поступление все новых многочисленных экспонатов привело к созданию зоологического, ботанического, лесного и экологического разделов. Основателем музея и его первым руководителем был талантливый художник, историк и краевед Петр Домашенко. Его трудами музей украшают фрески и картины, прекрасные витражи, своеобразные в каждом зале особенные орнаменты пола, многочисленные портреты ученых и краеведов, посвятивших свою деятельность изучению природы и истории Каневщины. Экскурсия по музею продемонстрирует посетителям всю историю формирования природы и человека в регионе от периода около 60 млн лет тому назад до современности. В теплое время года посетители музея могут не только осмотреть экспозицию, но и в сопровождении его сотрудников в течение часа пройти по одному из трех экологических маршрутов. В зимнее время в зале, рассчитанном на 60 посетителей, можно посмотреть научно-популярные фильмы о деятельности Каневского природного заповедника.