Музей відкрито на честь 250-річчя мислителя, однак ідея його створення з’явилася ще далекого 1922 року. Споруда, в якій він розташований, належала поміщикам Ковалевським і була побудована у XVIII столітті. Раніше її використовували як садовий павільйон. На території меморіального комплексу знаходиться красивий англійський парк, скульптури, колодязь письменника, дуб (дерево є пам’яткою історії XVIII століття) і перше місце поховання Григорія Сковороди. На одній з алей парку стоїть пам’ятник філософу, створений скульптором І. П. Кавалерідзе.