Чимала кількість нагромаджених робіт стала приводом для відкриття музею в місті. Спочатку був тільки відділ природи в краєзнавчому музеї, але за допомогою І. Пачоського виділили окреме приміщення для нового музею. У 1904 році почалося створення музею. А в 1905 він уже мав у своєму фонді тисячу п’ятсот сімдесят два експонати. Для самого зібрання комах треба було сім шаф. У 1906 році музей прийняв перших відвідувачів. Музей також від початку свого відкриття брав участь у багатьох виставках і по інших містах, за що його відзначили преміями та нагородами. Рідкісні колекції, зібрані польським біологом, мали величезну історичну і наукову цінність. Під час війни ані сам музей, ані його експонати не були пошкоджені, хоча деякі предмети німцям все ж вдалося вивезти. У повоєнний період музей відновив свої фонди і на сьогодні це унікальна наукова база, якою користуються студенти України і багатьох інших країн.