Це поселення з XIV століття належало славному роду Острозьких, прабатьком якого був уславлений волинський сподвижник – князь Федір Острозький. Відомо, що князю належала дерев’яна церква на честь святої Трійці, яка згоріла в середині XV століття. Саме на місці цієї древньої дерев’яної церкви почалося будівництво помпезного Свято-Троїцького храму. Точна дата його спорудження, як і ім’я архітектора, залишилися невідомі. Імовірно, дата завершення будівництва храму – 1460 рік. Православний храм заснували на щедрі грошові пожертви князя Івана Острозького. У 1603 році монастир передали католицькому Ордену францисканців, що призвело в 1606 році до початку грандіозного будівництва, яке перетворило розкішну будівлю храму на відмінно укріплену фортецю. 1854 рік приніс монастирю пожежу й втрату безцінного бібліотечного фонду, який нараховував 1900 книг. Пожежа 1913 року знищила всі господарські будівлі монастиря. У 1918 році в стінах монастиря розташовувалися німецькі війська. У 1921 році ця територія переходить до польських володінь. Поселення було прикордонним практично 20 років. У період 1925 – 1934 років влада веде тяганину з приводу передачі монастиря католикам, однак він залишається в руках православних. Незважаючи на всі історичні перипетії, монастирський комплекс уцілів. У 1967 – 1971 роках було проведено масштабні реставраційні роботи, а в 1991 році знову відкрили величний Межиріцький Свято-Троїцький монастир.