Станцію побудували 1908 року й назвали "Водопій". Свою теперішню назву залізничний вузол отримав під час будівництва вокзалу. Станція Миколаїв має три платформи і 28 колій. Належить до Херсонської дирекції Одеської залізниці. Будівля вокзалу являє собою двоповерхову споруду прямокутної форми, фасад якої прикрашає циферблат годинника. На станції Миколаїв здійснюється продаж квитків, є кімнати відпочинку, камери зберігання багажу.