Довгий час після відкриття печери вхід до неї було ускладнено через розмиття. Проте завдяки багатьом бажаючим дослідити її зсередини і зусиллям київської групи дослідників-спелеологів "Карст" під керівництвом І. Стефанишина, вхід було відновлено. На даний час печера не досліджена повністю. Як вже відомо, загальна довжина коридорів становить близько 1244 метри, а площа усіх коридорів і галерей – приблизно 1720 м2. Особливістю Олексинської печери є надмір підземних вод, що заповнюють коридори приблизно на половину їхньої загальної висоти. Тому для дослідження цієї печери радять обирати періоди, коли висота грунтових вод знижується, відкриваючи доступ огляду стін. В печері спостерігається дуже слабкий рух повітря, оскільки вона практично не провітрюється.