Першим був створений відділ природи та історії в 1940 році. Він розташований у будівлі колишньої Дрогобицької повітової ради, побудованій у 1894 році, та є пам’ятником архітектури і містобудування. Базою для створення і розвитку музею стали приватна колекції графа Лянцкоронського, експонати з Хіревскої єзуїтської школи, музеїв Самбора та Трускавця. Нині музейний фонд об’єднують експозиції, що складаються з археологічних та етнографічних матеріалів, документів, фотографій, виробів ремісників минулих століть, знаряддя їх праці. Особливий інтерес у відвідувачів викликають стародруки, середньовічні ікони, картини відомих художників, предмети побуту та одяг, колекція італійської майоліки XV–XVII століть, китайського фарфору, зразки рослинного і тваринного світу Карпат. Тут можна простежити історію краю від епохи палеоліту до наших днів, а також побачити реліквії, пов’язані з відомими уродженцями краю: Юрієм Котермаком (Дрогобичем), Іваном Франком, Уляною Кравченко, Михайлом Драганом. Вражає своєю реалістичністю діорама-макет "Повстанська криївка", яку виготовили за описом командира УПА Степана Стебельського. Тему боротьби за незалежність розкриває й меморіальна кімната полковника Січових Стрільців, Голови Проводу ОУН Андрія Мельника.