Спершу, в XVI-XVII століттях, на Китай-горі жили паломники Києво-Печерської Лаври.До архітектурного ансамблю монастиря входить Троїцька церква, трапезна, церкви Дванадцяти апостолів і Трьох російських святителів, дзвіниця, будинок настоятеля, братський корпус, будинок для старих священнослужителів, келії. Від 1898-го року тут містився свічковий завод.У 1920-ті роки радянська влада організувала тут дитячу колонію, а згодом територія перейшла до Інституту плодового та ягідного господарства.За часів Другої світової війни монастир було частково зруйновано. По війні в його стінах розташувався комбінат бджільництва.1965-го року розпочинається відродження Китаєвого: монастир отримав статус пам’ятки археології. Коли Україна здобула незалежність, Китаївську пустинь передали Українській Православній Церкві.