Свято-Троїцька церква має тримісну форму в плані, квадратний неф та прямокутний бабинець, апсиду. Збігаються між собою осі зрубів і вісь споруди. Центровим в плані є середній зруб. На світловому восьмерику височіє шатровий верх. Пласкі вітрила, розташовані паралельно підлозі, є плавним переходом від четверика до восьмигранного об’єму. Вікно, розташоване в південній стіні бабинця, є єдиним джерелом світла. Воно з’єднується прямокутною аркою-вирізом з простором нефа. До церкви прилягає дерев’яна дзвіниця, виконана в єдиному стилі з храмом. Троїцька церква розташовується в центрі села Михалківці. Служіння проходить за розкладом.