З метою збереження історії Миколаївського 100-річного зоопарку в 1988 році створили його музей. Експонати збирали з усіх можливих куточків і колекцій. На стенді засновника зоопарку М.П. Леонтовича розміщуються фотографії та інші пам’ятні артефакти, а по центру музейного приміщення встановлений його портрет. В центрі залу знаходиться макет нового парку тварин 1989 року. Але більш за все увагу відвідувачів привертають колекції "мокрих" експонатів. В ємностях з скла зберігаються чорноморська риба "морський півень", а її фотографія кінця 20-х років XX століття також виставлена на огляд, ембріон кита фінвала, різновиди новонароджених тварин і деякі окремі їх органи, гельмінти. Більшу частину музейної експозиції складають зібрання з опудал і черепних коробок тварин, починаючи від мініатюрної ласки й димчатого леопарду, і закінчуючи слоном і бегемотом.