Залізничне полотно проклали в 1879-му році. Ну а станцію збудували більш ніж через 25 років. За часів Радянського союзу рух там був досить жвавий. Але на початку дев’яностих, поїздів ставало все менше і менше. Однак по станції все одно курсували поїзди далекого прямування. Після того, як почалися військові дії і був зруйнований один з мостів, проїзд пустили в обхід станції. У 2014-2015-му році на Вовчоярський зупинялися поїзди, але потім їх зняли з маршруту через брак палива.