Музей був відкритий в травні 1985 року. Його перший зал присвячений подіям Національної Визвольної війни українського народу 1648-1654 років і перемозі Богдана Хмельницького на Жовтій річці 16 травня 1648. До експозиції включено меморіальні експонати: козацька трубка кінця XVII століття, наконечник козацького списа, обладунки польського лицаря XVII століття. Другий зал відображає розвиток селища Жовта Ріка. Тут можна побачити макети львівського кар’єра, шахти "Капітальна", колекцію старовинних предметів побуту. Третій зал ( "Бойової Слави") відображає роки Великої Вітчизняної війни. Тут зібрані фотоматеріали, зброя часів війни, німецький багнет, каска, фляга і ін. Четвертий і п’ятий зали висвітлюють історію розвитку міста та підприємств, спортивну та освітню життя. Тут можна побачити макет міста Жовті Води. У п’яти залах другого поверху виставлена колекція годинників, мінералів, графіки, живопису, художньої вишивки та скульптури, а також експонуються картини жовтоводських художників. З 1999 року музей носить ім’я почесного громадянина міста Юхима Ілліча Пригожина – ініціатора створення міського музею.